Лікар-ендоскопіст виконує діагностичні і лікувальні втручання на органах травлення і дихання за допомогою гнучких ендоскопів. Проводить гастроскопію, колоноскопію, ректороманоскопію, бронхоскопію, при потребі бере біопсію, видаляє поліпи, зупиняє кровотечі, розширює стриктури. Висновки ендоскопіста — ключові для постановки діагнозу при захворюваннях стравоходу, шлунка, кишечника та дихальних шляхів. Робота вимагає високої технічної майстерності і знання сучасних протоколів безпеки і стерилізації.